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癌症免疫调节中的肠道微生物代谢产物

Mol CancerPMID:41339918
癌症免疫调节中的肠道微生物代谢产物

肠道微生物群衍生的代谢产物正逐渐成为全身性的“远程免疫调节因子”,它们可塑造全身各组织的肿瘤免疫。综合短链脂肪酸、色氨酸衍生物、次级胆汁酸、多胺及其他代谢产物的相关证据,我们提出了一个代谢产物 - 免疫途径 - 癌症框架,该框架将受体介导的信号传导、表观遗传重塑和代谢重编程与依赖于环境的双向免疫效应联系起来。重要的是,除了G蛋白偶联受体/芳烃受体途径外,所选的微生物小分子代谢产物还是非常规T细胞真正的T细胞受体配体,直接塑造组织驻留免疫和肿瘤微环境,补充了我们框架中的受体信号传导和表观遗传程序。我们综合阐述了这些代谢产物如何重新校准肿瘤免疫微环境,调节抗原呈递、T细胞效应功能及耗竭、调节性T细胞活性和髓系极化,以及为何相同的代谢产物根据配体 - 受体配对、剂量和组织微环境的不同,既可以增强免疫监视,也可以巩固免疫抑制。我们比较了肿瘤类型特异性模式(如结直肠癌、肝癌、肺癌、乳腺癌和前列腺癌),以突出常见的通路和器官特异性特质。在方法学上,我们概述了单细胞和空间多组学、成像质谱和功能生物传感器如何实现人类肿瘤中代谢产物暴露与免疫细胞状态的共定位,为生物标志物发现提供了可操作的基础。鉴于目前对于低生物量肿瘤组织中瘤内微生物群所产生信号存在争议,我们重点关注可量化、可空间映射且在药理学上易于处理的代谢产物 - 受体途径,使用微生物相关分子模式/易位作为比较对象,以判断何时应将化学信号优先作为干预靶点。最后,我们评估了精准干预途径,包括粪便微生物群移植、合理的细菌联合体、工程微生物和基于纳米颗粒的代谢产物递送,并提出了将代谢产物/受体特征与适用递送方式配对的分层规则。总之,绘制组织特异性代谢产物 - 免疫回路并将其嵌入强大的生物标志物框架中,可能会将微生物代谢产物从相关标志物转化为治疗靶点和工具,提高癌症免疫治疗的疗效和持久性。

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捕食风险加剧了杀菌剂驱动的关键分解者摄食和行为抑制,减缓了淡水落叶的降解。

Environ PollutPMID:41349946

化学污染是日益严重的全球威胁,淡水栖息地拥有不成比例的生物多样性并提供关键的生态系统服务,如今面临着化学和生物应激源的重叠,其综合影响会加速生物多样性丧失。杀菌剂在林业和农业中大量使用,常常渗入淡水环境,但其影响仍未得到充分研究,尤其是诸如猎物行为变化或食腐动物介导的分解等亚致死影响。我们在实验室中采用2×2析因微观实验,研究了一种广泛使用的三唑类杀菌剂(戊唑醇)和一种常见生物应激源(蜻蜓捕食者)对关键食腐动物——淡水等足类动物水生阿氏摇蚊的交互作用。我们将等足类动物分组饲养,设置两种杀菌剂(0与50微克/升戊唑醇)和两种捕食者(有无笼养捕食者)处理的组合,21天后评估其性能变化(行为活动、食物消耗),随后在自由捕食者存在的情况下进行生存测定。我们发现,相对于良性条件(清洁水且无捕食者),单独的戊唑醇使摄食量减少89%,捕食者线索使摄食量减少44%,而两种应激源共同作用使摄食量减少91%,这表明化学应激超过了捕食者的影响。在无笼养捕食者的情况下饲养的等足类动物,在接触捕食者线索时行为活动减少了35%,而接触杀菌剂的同种个体则没有行为变化,这表明威胁检测受损。有捕食者的先前经历使对抗自由捕食者的存活率几乎翻倍(无捕食者经验的等足类动物存活率为45%,有笼养捕食者饲养的等足类动物存活率为80%),但这种优势在杀菌剂处理中消失了(存活率为62%)。总体而言,我们的结果表明,与环境相关的农药浓度会改变猎物行为,增加捕食风险,并可能破坏调节养分循环的营养相互作用的稳定性。这些发现强调了进行淡水风险评估的必要性,该评估应考虑多种相互作用的应激源如何影响生物及其所支持的生态系统功能。

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大B细胞淋巴瘤:LYSA实用指南。

Eur J CancerPMID:41352004

在过去5年中,大B细胞淋巴瘤(LBCL)的管理发生了重大变化。这些变化反映了新疗法(免疫疗法、细胞疗法、靶向分子)的出现,也反映了对这些实体及其特定临床特征的更好分类。目前有众多一线、二线和三线治疗策略可供选择,每位从业者都致力于选择在疗效和毒性之间取得最佳平衡的治疗方法。近年来,对LBCL生物学理解的进展,以及诊断、监测工具和治疗方法的改进,显著改善了患者的治疗结果。在本文中,我们介绍了淋巴瘤研究协会(LYSA)制定的一套关于LBCL管理的实用指南。这些指南涉及诊断、分期、反应评估和治疗的关键方面,整合了来自临床试验、专家共识和实际临床实践的最新证据。它们旨在为临床医生提供一个清晰、实用的框架,以优化对LBCL患者的治疗,确保将最佳现有证据转化为临床实践。

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用于癌症治疗的纳米/微米级靶向RNA递送系统。

Int J PharmPMID:41349874

RNA疗法已成为一种治疗癌症的变革性方法。然而,由于存在诸如酶降解、网状内皮系统(RES)清除和低转染效率等生物屏障,RNA疗法的临床应用面临重大挑战。为了解决这些局限性,大量工程化的纳米/微米级载体已被深入研究并广泛用于RNA的靶向递送。在这项工作中,我们总结了对纳米/微米级靶向RNA递送系统的全面综述,并对挑战和机遇给出了关键见解。我们首先回顾了癌症治疗中用于RNA递送的各种纳米/微米级载体和技术,包括脂质纳米颗粒、聚合物胶束、水凝胶、微针、外泌体、纳米颗粒、金属有机框架、共价有机框架和活细胞。我们进一步总结了挑战,强调了实现高治疗效果和最小副作用的潜力。最终,对纳米/微米级靶向RNA递送系统的前景进行了深入讨论。总体而言,我们认为基于纳米/微米级递送策略的RNA疗法可能会在临床领域得到应用,以促进癌症治疗的改善。

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不同BMI类别下营养状况与全身免疫炎症指标之间的关系。

NutrientsPMID:41374089
不同BMI类别下营养状况与全身免疫炎症指标之间的关系。

本研究旨在利用四项经过验证的营养指标——血红蛋白、白蛋白、淋巴细胞和血小板(HALP)评分、预后营养指数(PNI)、控制营养状况(CONUT)评分和营养风险指数(NRI),以及三项免疫炎症生物标志物——全身免疫炎症指数(SII)、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)和血小板与淋巴细胞比值(PLR),确定不同体重指数(BMI)水平的健康成年人营养状况与全身炎症之间的关系。这项回顾性研究纳入了290名年龄在18至60岁之间的临床健康成年人,并根据BMI进行了分类。排除患有慢性病、正在使用药物或病态肥胖(BMI≥40kg/m²)的个体。根据实验室数据计算营养评分(HALP、PNI、NRI、CONUT)和全身免疫炎症指数(SII、NLR、PLR)。为了比较组间的SII、PLR、NLR、PNI、HALP、NRI和CONUT值,对年龄进行了校正,并进行了协方差分析。在全身免疫炎症指数中,超重和肥胖组的SII和NLR均显著更高。CONUT评分作为营养状况的负指标,在超重组中与SII、NLR和PLR呈正相关,在肥胖组中与PLR呈正相关。尽管两组中PNI均与SII、PLR和NLR呈显著负相关,但PNI的平均值得分仍高于50,表明研究人群的总体营养状况正常。两组中HALP均与SII、PLR和NLR呈负相关。HALP评分似乎是最可靠的标志物,因为它反映了营养状况与全身免疫炎症指数之间的负相关关系。

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锥体神经元细胞类型的分层组织定义了海马体CA1区的不同亚区域。

Nat CommunPMID:41339324
锥体神经元细胞类型的分层组织定义了海马体CA1区的不同亚区域。

研究海马体CA1区的细胞类型组织对于理解其在记忆和认知中的作用以及对阿尔茨海默病和癫痫等神经系统疾病的易感性至关重要。多项研究已经确定了基因表达的不同组织原则,以及它如何反映CA1锥体层内的细胞类型,包括梯度或镶嵌模式。在这里,我们确定了小鼠CA1锥体层内跨越整个海马轴的亚层基因表达模式。我们的研究结果表明,CA1亚区域(CA1d、CA1i、CA1v、CA1vv)包含成分细胞类型的差异分布层,并且可以通过区域基因表达特征来识别。这项工作为CA1细胞类型的组织提供了一个新的视角,可用于进一步探索跨物种的海马体细胞类型。

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薯蓣皂苷通过上调Cx43抑制VEGFA/PI3K/Akt/mTOR通路来抑制胃癌中的上皮-间质转化。

PhytomedicinePMID:41353880

背景:连接蛋白43(Cx43)和Cx43间隙连接细胞间通讯(Cx43 - GJs)在转移过程中发挥重要作用。虽然薯蓣皂苷在多种癌症中表现出显著的抗癌活性,但其对胃癌(GC)中Cx43/Cx43 - GJs的影响仍知之甚少。 目的:本研究旨在阐明植物源化合物薯蓣皂苷对胃癌细胞的抗转移疗效及潜在机制。 方法:我们整合网络药理学、分子对接和动力学模拟来确定靶点。利用体外模型(过表达、G21R突变体、siRNA敲低)和体内异种移植模型,通过蛋白质免疫印迹法、免疫荧光法、伤口愈合实验、Transwell实验和免疫共沉淀实验,评估薯蓣皂苷对增殖、侵袭、迁移、上皮 - 间质转化(EMT)和信号通路的影响。 结果:生物信息学分析突出了VEGFA/PI3K/AKT/mTOR通路是胃癌恶性肿瘤的核心通路。薯蓣皂苷通过上调Cx43并增强间隙连接功能,以时间和浓度依赖性方式抑制该轴。功能缺失(siRNA/G21R)和挽救实验证实功能性Cx43对薯蓣皂苷的疗效至关重要。G21R突变体揭示了Cx43的支架功能在信号调节中的关键作用。薯蓣皂苷通过Cx43介导的“双屏障”机制——加强上皮粘附和触发迁移抑制——有效抑制EMT和细胞运动。 结论:本研究阐明了薯蓣皂苷通过Cx43介导的对VEGFA/PI3K/AKT/mTOR信号的抑制作用来抑制胃癌的新机制,并将Cx43确立为连接天然化合物与致癌途径的关键纽带。Cx43的非通道支架功能为胃癌干预提供了新的理论框架和治疗策略。

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工程化抗肿瘤免疫:mRNA癌症疫苗的免疫框架

Vaccines (Basel)PMID:41441688
工程化抗肿瘤免疫:mRNA癌症疫苗的免疫框架

信使核糖核酸(mRNA)疫苗重新定义了癌症免疫治疗格局,成为快速可行的临床策略,有助于诱导强大的肿瘤特异性免疫反应。本综述重点介绍了mRNA工程和抗原设计方面的当前进展,以建立用于癌症疫苗开发的综合免疫学框架。要实现持久的临床益处,仅靠抗原表达是不够的。有效的疫苗需要精确的表位选择、优化的递送系统和严格的免疫监测。该领域正在从单纯诱导免疫反应转向更多地关注生物化学和分子设计原则,这些原则结合了免疫反应的强度、多功能性和持久性,以克服肿瘤诱导的免疫抑制。我们研究了用于mRNA癌症疫苗开发的综合免疫学框架,探讨了从核苷修饰、密码子优化到非翻译区和连接子序列等疫苗成分的合理分子工程如何塑造免疫原性和治疗效果。未来的发展方向将取决于平衡将疫苗接种与免疫检查点抑制剂和过继性细胞疗法相结合的联合策略。

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中性粒细胞区室的结构。

NaturePMID:41339555
中性粒细胞区室的结构。

中性粒细胞在不同组织和疾病中表现出显著的表型和功能多样性,然而,对这个免疫细胞群如何整体组织起来的缺乏了解,给临床转化带来了挑战。在这里,我们对跨越47种解剖、生理和病理情况的中性粒细胞进行了单细胞转录谱分析,以生成小鼠中性粒细胞整体细胞群的综合图谱,我们将其称为NeuMap。NeuMap整合并扩展了现有模型,以产生全新的基本见解;它揭示了中性粒细胞在有限数量的功能中心中组织起来,这些中心在成熟过程中依次分布,然后分支为干扰素反应性和免疫抑制状态,以及在健康循环中占主导地位的功能沉默状态。计算建模和时间戳分析确定了连接这些中心的典型轨迹,并揭示了在健康、炎症和癌症期间动态和偏好路径有所不同。我们表明,转化生长因子β(TGFβ)、干扰素β(IFNβ)和粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)推动中性粒细胞沿着不同轨迹发展,将染色质可及性位点投射到NeuMap上显示,转录因子JUNB控制血管生成和免疫抑制状态并促进组织再血管化。NeuMap的结构似乎在性别、环境和遗传背景以及人类中都是保守的。最后,我们表明NeuMap能够通过分析血液中的中性粒细胞来推断宿主的病理生理状态。我们的研究描绘了中性粒细胞细胞群的整体结构,并建立了一个探索和利用中性粒细胞生物学的框架。

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SpeckSeq技术可实现对自身炎症性疾病中MEFV变异体的高通量功能分层。

J Exp MedPMID:41335224

意义未明的变异(VUS)是基因诊断中的主要障碍,尤其是当涉及在计算机模拟中预测不佳的功能获得性(GoF)突变时。编码炎性小体传感器吡啶蛋白的MEFV在两种自身炎症性疾病中发生突变,即家族性地中海热(FMF)和伴有嗜中性皮肤病的吡啶蛋白相关自身炎症(PAAND)。在此,我们开发了SpeckSeq,一种结合DNA条形码、基于ASC斑点的单细胞分选和下一代测序的方法,以系统地鉴定响应不同刺激的超显性MEFV变异。SpeckSeq鉴定出49个GoF突变,分为两个不同的组,分别包含PAAND变异或FMF变异。SpeckSeq使用患者细胞进行了验证,并支持对MEFV变异致病性的重新分类,从而得出新的诊断结果。作为一种大规模诱变方法,以人类遗传学为指导,SpeckSeq揭示了吡啶蛋白的结构和功能特征,包括B30.2结构域中一个假定的配体容纳腔。总之,SpeckSeq对VUS进行分类,以完善分子诊断并增进我们对吡啶蛋白炎性小体的了解。

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用于设计靶向α-突触核蛋白原纤维结构多晶型物的肽抑制剂的人工智能引导双策略

CellsPMID:41369409
用于设计靶向α-突触核蛋白原纤维结构多晶型物的肽抑制剂的人工智能引导双策略

帕金森病及相关疾病发病机制中最重要的事件之一,是通过富含β-折叠结构的α-突触核蛋白(α-syn)聚集形成异常纤维。冷冻电镜的应用揭示了纤维的不同多晶型,每种多晶型都有独特的结构界面,这使得抑制剂的设计更具挑战性。在此,建立了一个结合人工智能辅助肽生成的结构导向框架,目标是靶向各种形式的α-syn纤维中存在的保守β-折叠基序。然后,使用ProteinMPNN、AlphaFold-Multimer和PepMLM来创建能够干扰纤维生长的短肽。通过硫代黄素T(ThT)荧光降低以及无定形或碎片化聚集体的产生来衡量,所选的两个候选肽T1和S1对α-syn纤维形成有显著抑制作用。肽的抑制效力与预测的界面能一致。这项研究工作表明,将冷冻电镜结构知识与计算设计方法相结合,能够快速发现广谱肽抑制剂,这是精准治疗神经退行性疾病的一个良好策略。

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CHAF1A的泛素化与N-乙酰葡糖胺化之间的相互作用调控HIV-1潜伏与激活。

J VirolPMID:41334912

潜伏的HIV-1病毒库的持续存在仍然是治愈的关键障碍。目前的“激活并清除”策略受到无效的潜伏期逆转剂(LRA)以及对表观遗传调控了解不足的限制。在此,我们确定染色质组装因子1亚基A(CHAF1A),一种维持HIV-1潜伏状态的组蛋白伴侣,为受拮抗性翻译后修饰调控的治疗靶点:泛素化促进其降解,而O-连接N-乙酰葡糖胺化使其稳定。我们证明,一种经美国食品药品监督管理局批准的抗病毒药物三氟尿苷,通过破坏O-连接N-乙酰葡糖胺化、触发CHAF1A泛素化和蛋白酶体降解来重新激活潜伏的HIV-1。值得注意的是,CHAF1A在CD4 T细胞(>60岁)中的表达随年龄增加,与更深的前病毒库相关。这种年龄依赖性积累与O-连接N-乙酰葡糖胺酶水平降低呈负相关,提示衰老过程中O-连接N-乙酰葡糖胺化介导的稳定作用。我们的研究结果将CHAF1A确立为一个治疗靶点和一个年龄分层生物标志物,推动三氟尿苷作为一种可转化的LRA,以增强老年人群中病毒库的清除——这一人群越来越受到HIV-1持续存在的影响。重要性HIV-1潜伏仍然是实现治愈的重大障碍,特别是在以扩大的病毒库和受损的免疫恢复为特征的老年人群中——由于缺乏专门针对与年龄相关机制的疗法,这一挑战进一步加剧。目前的潜伏期逆转剂不足以解决维持老年人病毒持续存在的代谢和表观遗传失调问题。在这项研究中,我们揭示了泛素化和O-连接N-乙酰葡糖胺化之间的动态相互作用,该相互作用调节CHAF1A的稳定性,CHAF1A是维持HIV-1潜伏状态所必需的组蛋白伴侣。我们确定三氟尿苷为一种新型LRA,能够破坏O-连接N-乙酰葡糖胺化以降解CHAF1A,从而有效逆转原代细胞中的潜伏期。这项研究弥合了基础病毒学与临床老年医学之间的关键差距。这些发现为完善旨在根除HIV-1的策略奠定了坚实基础,重点是针对宿主代谢-表观遗传网络以解决未得到充分服务的老年人群中的潜伏期问题。

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肥胖个体中蔬菜来源的硝酸盐和亚硝酸盐摄入量与心血管危险因素及血糖标志物之间的关联。

Sci RepPMID:41339432
肥胖个体中蔬菜来源的硝酸盐和亚硝酸盐摄入量与心血管危险因素及血糖标志物之间的关联。

尽管植物源硝酸盐和亚硝酸盐因其潜在的代谢优势而日益受到认可,但目前的研究结果喜忧参半。本研究探讨了伊拉克超重和肥胖成年人蔬菜来源的硝酸盐和亚硝酸盐摄入量与关键代谢指标之间的关系。共有338人参与了一项横断面分析,他们完成了一份经过验证的食物频率问卷,以量化从蔬菜中摄入的硝酸盐和亚硝酸盐。使用标准血压计测量血压,并通过酶法测定包括空腹血糖、血脂谱和胰岛素在内的生化指标。蔬菜硝酸盐摄入量最高的参与者与摄入量最低的参与者相比,收缩压显著降低(P<0.05)。同样,在粗统计模型和校正统计模型中,饮食中亚硝酸盐摄入量的增加与空腹血糖和总胆固醇水平降低以及高密度脂蛋白胆固醇增加有关(P<0.05)。蔬菜中硝酸盐和亚硝酸盐摄入量的增加似乎与超重和肥胖个体良好的心血管和代谢健康指标有关。这些结果凸显了食用蔬菜源硝酸盐和亚硝酸盐作为改善心血管代谢结局的饮食策略的潜力,值得通过纵向研究进一步探究。

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氧气浓度升高对小鼠FLASH保护效应的影响具有组织依赖性。

Br J RadiolPMID:41339268

目的:先前的研究结果报告称,在补充氧气的情况下进行的FLASH放疗(FLASH)毒性增加,但未能量化FLASH保护效应大小的变化。本研究使用急性胃肠道和皮肤毒性的小鼠模型,研究了吸氧对FLASH和传统放疗(CONV)后正常组织并发症概率(NTCP)的影响。 方法:无肿瘤的C57BL/6和BALB/c小鼠分别接受全腹或皮肤照射,采用CONV或FLASH。在两个模型中,分别在空气呼吸和吸氧条件下进行剂量递增,以确定NTCP曲线。FLASH剂量修正因子(DMF)定义为50%NTCP时的剂量比。通过磷光猝灭氧传感在体内测量从空气呼吸到吸氧过程中组织氧合的变化。 结果:空气呼吸下的腹部照射显示出显著的FLASH保护效应,平均DMF为1.14。在吸氧条件下,这种效应消失,平均DMF降至1.00。相比之下,空气呼吸下的皮肤照射显示出强烈的FLASH保护效应,平均DMF为1.42,在吸氧条件下基本保持(平均DMF = 1.40)。吸氧显著增加了肠道和皮肤的组织氧合。 结论:在增加氧合的情况下维持FLASH保护效应是组织依赖性的。我们的研究结果表明CONV和FLASH氧增强比(OER)曲线存在潜在差异。 知识进展:通过在动物模型中进行剂量递增实验,我们首次量化了组织氧合增加时FLASH保护效应大小的变化。

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多组学分析揭示乳腺癌中的肿瘤异质性和免疫治疗预测模型,以实现精准医学和早期检测。

NeoplasiaPMID:41344266
多组学分析揭示乳腺癌中的肿瘤异质性和免疫治疗预测模型,以实现精准医学和早期检测。

背景:肿瘤内异质性导致乳腺癌的治疗耐药性和免疫逃逸,使治疗策略更加复杂。本研究整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学和批量RNA-seq反卷积技术,以表征肿瘤亚群并开发一个强大的预后模型。 方法:我们采用多组学方法,结合scRNA-seq、空间转录组学和批量RNA-seq数据反卷积技术,探索乳腺癌肿瘤内的分子多样性。根据不同的基因表达谱确定肿瘤亚型,并进行功能通路分析,以评估与临床结果的关联,包括治疗耐药性和免疫逃逸。整合来自TCGA和GEO队列的数据,以验证预后和免疫相关的研究结果。使用CoxBoost+GBM算法开发一个强大的预后模型,用于预测患者生存和免疫治疗反应。 结果:确定了五种不同的肿瘤亚型,每种亚型都有独特的功能特征,突出了乳腺癌异质性的复杂性。发现基底样乳腺癌(BLBC)细胞在免疫逃逸和免疫治疗反应不佳中起核心作用,高基底样细胞浸润与较差的生存结果相关。空间转录组学显示BLBC细胞在包括ER+肿瘤在内的临床亚型中广泛存在,表明它们参与了治疗耐药性。基于CoxBoost+GBM的预后模型对患者生存和免疫治疗疗效具有很强的预测能力。 结论:本研究全面了解了乳腺癌异质性的遗传和免疫决定因素,重点关注BLBC在免疫逃逸和治疗耐药中的作用。这些见解增强了多组学方法在精准预防、早期检测和个性化免疫治疗策略中的潜力。

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跨空间转录组学平台的基因表达联合插补与反卷积

Genome ResPMID:41249066

空间分辨转录组学(SRT)技术可测量组织切片内数千个空间位置的基因表达。目前有多种SRT技术可供使用,其他技术也在积极研发中,每种技术具有不同的空间分辨率(亚细胞、单细胞或多细胞区域)、基因覆盖范围(靶向与全转录组)以及每个位置的测序深度。例如,广泛使用的10x Genomics Visium平台可从多个细胞大小的斑点测量全转录组,而10x Genomics Xenium平台可在亚细胞分辨率下测量数百个基因。许多研究将多种SRT技术应用于源自同一生物组织的切片。整合来自不同SRT技术的数据可以克服单个技术的局限性,从而能够在靶向技术中估算未测量基因的表达和/或从具有较低空间分辨率的技术中反卷积混合表达。在此,我们介绍用于估算和反卷积的空间整合(SIID),这是一种从不同SRT技术的一对观测值重建潜在空间基因表达矩阵的算法。SIID利用空间比对并使用联合非负分解模型来准确估算缺失的基因表达,并从混合的SRT数据中推断细胞类型的基因表达特征。在涉及来自不同技术(例如,Xenium和Visium)的配对SRT数据集的模拟中,与当代工具相比,SIID在重建斑点到细胞类型的分配、恢复细胞类型特异性基因表达和估算缺失数据方面表现出卓越的性能。当应用于来自人类乳腺癌和结肠癌组织的真实世界10x Xenium-Visium配对数据时,SIID在估算保留基因表达方面表现出最高的性能。

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药学教育中的人工智能:当前整合情况与全球认知的范围综述

Curr Pharm Teach LearnPMID:41343996

背景:人工智能(AI)的快速发展正在重塑医疗保健领域,包括药学领域,这就需要精通AI的药学专业毕业生。因此有必要了解AI在药学教育中的应用方式。本综述旨在总结当前关于AI在药学教育中的文献,包括其实施情况以及学生和教师的看法,并研究这些应用与认证标准的一致性,以为未来的课程开发提供参考。 方法:在PubMed、Scopus、Embase、CINAHL和谷歌学术上进行文献检索,以查找关于AI在药学教育中的研究。文章分为创新研究或认知研究。创新研究进行主题分析以确定实际应用,而认知研究则了解对AI的熟悉程度以及将其纳入课程的意愿。将AI应用与药学教育认证委员会(ACPE)和加拿大药学项目认证委员会(CCAPP)的标准进行比对。 结果:共纳入20篇文章(10篇创新研究,10篇认知研究)。教师将AI用于评估、评价和反思性写作分析。学生将AI用于个性化学习、加强沟通和基于问题的学习。一些研究报告称对AI的熟悉程度较高;另一些则显示知识有限。然而,观察到将AI纳入药学教育的意愿强烈,学生希望有更多以AI为重点的课程。将AI应用与认证标准进行比对表明,AI的整合可以支持教育成果和能力要求。 结论:研究结果突出了AI在药学教育中的潜在应用,强调了将AI纳入药学课程的必要性。与认证标准的一致性表明,AI的整合满足了不断变化的专业需求,并维持了药学项目的质量标准。

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胰腺导管腺癌中的肿瘤微环境与免疫代谢重编程:免疫治疗中的障碍与突破

Int ImmunopharmacolPMID:41337835

在临床上,鉴于胰腺导管腺癌(PDAC)具有高度免疫抑制性和异质性的肿瘤微环境(TME),实现对其的有效治疗是一项重大挑战。新出现的证据证明了免疫代谢在塑造TME和推动PDAC进展中的关键作用。在高度免疫抑制和异质性TME的驱动下,经历代谢重编程的肿瘤细胞能够适应低氧环境。这些代谢改变可能进一步促进肿瘤的存活和侵袭,并损害免疫亚群的功能和表型。由此产生的代谢-免疫相互作用随后可诱导免疫逃逸并促进肿瘤进展。免疫治疗方面的最新突破揭示了对抗免疫抑制性TME和改善患者预后的潜在策略。因此,本综述旨在全面、详细地概述目前对PDAC免疫微环境和代谢调节的理解。此外,它还探讨了治疗转化中的关键挑战,并概述了干预机会。通过研究免疫功能障碍与代谢途径之间的复杂关系,预计本研究将探索创新策略以增强免疫治疗的潜力,从而为PDAC患者的治疗选择提供有效性和个性化。

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源于人工智能聊天机器人交互的妄想体验或“人工智能精神病”。

JMIR Ment HealthPMID:41273266

人工智能(AI)融入日常生活带来了前所未有的人机交互形式,促使精神病学重新审视环境、认知和技术之间的界限。本观点文章回顾了“AI精神病”的概念,这是一个框架,用于理解与对话式AI系统的持续接触如何在易受影响的个体中引发、放大或重塑精神病体验。本文借鉴现象学精神病理学、应激易感性模型、认知理论和数字心理健康研究,将AI精神病置于易感性与算法环境的交叉点。它并非定义一个新的诊断实体,而是研究沉浸式和拟人化的AI技术如何调节感知、信念和情感,改变作为人类体验基础的前反思性现实感。该论点通过4个互补的视角展开。首先,在应激易感性模型中,AI充当一种新型的社会心理应激源。其全天候可用性和情感反应性可能增加应激负荷、干扰睡眠并强化适应不良的评估。其次,数字治疗联盟是一个描述与数字系统的关系参与的概念,被概念化为一种双刃剑式的调解因素。虽然共情设计可以增强依从性和支持,但AI系统不加批判的验证可能会强化妄想信念或认知固执,颠覆针对精神病的认知行为疗法的矫正原则。第三,心理理论的干扰提供了一条认知途径:心理化受损或过度活跃的个体可能将意图或共情投射到AI上,将聊天机器人视为有感知的对话者。这种二元错误归因可能形成一种“数字共享性精神病”,其中AI成为妄想 elaboration 中的强化伙伴。第四,包括孤独、创伤史、分裂型特质、夜间或单独使用AI以及算法对信念确认内容的强化等新出现的风险因素可能在个体和环境层面发挥作用。基于这一综合分析,我们提出了一个转化研究议程和五个行动领域:(1)使用纵向和数字表型设计的实证研究,以量化AI暴露、应激生理学和精神病症状之间的剂量反应关系;(2)将数字现象学整合到临床评估和培训中;(3)将治疗设计保障措施嵌入AI系统,如反思性提示和“现实检验”推动;(4)创建针对与AI相关的精神科事件的伦理和治理框架,以药物警戒为模型;(5)开发环境认知修复,这是一种预防性干预措施,旨在加强情境意识并将体验重新锚定在物理和社会世界中。通过将实证严谨性和治疗伦理应用于这个新兴界面,临床医生、研究人员、患者和开发者可以将潜在危害转化为一个加深对人类认知的理解、保障心理健康并促进AI在社会中负责任整合的机会。

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基于成像的空间转录组学数据集评估和可重复性的标准化指标。

Nat BiotechnolPMID:41339526

空间转录组学缺乏用于跨站点评估基于成像的原位杂交技术的标准化指标。在本研究中,我们通过集中切片从全球多个站点的六种组织类型生成了空间试金石(ST)数据集,并在Xenium和CosMx平台上进行了分析。选择这些平台是因其广泛应用和独特的化学性质。我们评估了重现性、灵敏度、动态范围、信噪比、错误发现率、细胞类型注释以及与单细胞分析的一致性。本研究提供了ST标准化操作程序(STSOPs)和开源软件SpatialQM,能够根据所有技术指标评估样本并直接推算细胞注释。生成的基于成像的空间转录组学数据存储库包含254个空间图谱,在一个基于网络的应用程序中整合了公共和新生成的ST数据集,可将用户数据与大量基于成像的数据集进行分析和比较。最后,我们建立了最佳实践和指标,以评估基于成像的单细胞多组学数据并将其整合到从空间转录组学到空间蛋白质组学中。

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遗传性多发性骨软骨瘤患儿的恶性肿瘤发生率:真实关联还是报告偏倚?

Pediatr RepPMID:41441317

背景:遗传性多发性骨软骨瘤(HME)是一种罕见的常染色体显性骨骼疾病,由EXT1、EXT2或EXT3基因的功能丧失变异引起。虽然恶性转化为软骨肉瘤已有充分记载,但HME中非骨骼恶性肿瘤的发病率和特征仍不清楚。 目的:我们旨在全面回顾文献中报道的HME患者非骨骼恶性肿瘤病例,并评估与血液系统癌症的潜在关联,特别是在儿科人群中。 方法:截至2025年8月,在PubMed数据库中使用与HME和恶性肿瘤相关的搜索词进行了广泛的文献检索。符合条件的报告包括确诊或疑似HME患者发生的非骨骼癌症的病例描述。提取的数据包括患者年龄、性别、癌症类型以及可用的基因或分子发现。 结果:确定了13例与HME相关的非骨骼恶性肿瘤病例。不到一半的病例进行了分子遗传学检测。6例发生在儿科患者中,其中4例涉及血液系统恶性肿瘤,3例白血病和1例伯基特淋巴瘤。在成人中,恶性肿瘤影响一系列器官系统,包括呼吸、胃肠、神经和内分泌系统。观察到明显的男性优势(11例男性对2例女性)。 结论:虽然无法确定明确的因果关系,但在报告的病例中,儿科HME患者的血液系统恶性肿瘤似乎占比过高。这一发现凸显了通过纳入临床和基因数据的大规模、基于人群的研究进行进一步调查的必要性。

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细胞间线粒体转移:中风治疗中的一种新型神经保护策略。

Eur J PharmacolPMID:41349711

中风仍然是全球范围内主要的死亡原因和长期残疾的根源。尽管血管再通疗法已经改变了急性护理,但有效的神经保护策略仍然缺乏。细胞间线粒体转移最近作为一种有前景的内源性修复机制受到关注。通过隧道纳米管、细胞外囊泡或细胞融合,健康的线粒体可以从供体细胞转移到受体细胞,帮助恢复受损神经元的生物能量稳态。这种现象在功能上类似于细胞器水平的代谢拯救,具有几个优点。它避免了与基因操作相关的伦理问题,利用内在的细胞间通讯进行靶向递送,并提供线粒体DNA互补来纠正代谢缺陷。在这里,我们整合了关于中风后线粒体交换的细胞来源、转移途径和调节机制的现有证据;描述了星形胶质细胞、间充质干细胞、小胶质细胞和内皮细胞在此过程中的协同作用;并批判性地评估了其转化前景以及成功临床应用必须克服的关键障碍。

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Decoding the role of mesothelin in tumor dynamics and targeted treatment innovations.

Mol BiomedPMID:41335396
Decoding the role of mesothelin in tumor dynamics and targeted treatment innovations.

Mesothelin (MSLN) is among the most studied cancer-related antigens, and it is extensively studied as a therapeutic target for the treatment of various malignancies, including pleural mesothelioma, pancreatic ductal adenocarcinoma, and ovarian cancer. However, despite the development of many MSLN-targeting strategies, such as antibody-drug conjugates (ADC), bispecific antibodies, and CAR-T cells, clinical responses have remained limited, underscoring the need for a deeper understanding of MSLN biology. Over the past decades, many studies have highlighted a link between MSLN and cancer progression and its association with specific features within the tumor microenvironment (TME). More recently, mechanistic evidence has emerged showing the involvement of MSLN in the establishment of key malignant features, such as the epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) and matrix metalloproteinase 7-mediated remodeling of the extracellular matrix (ECM). Furthermore, these studies also show a direct role for MSLN in the immunosuppressive polarization of the TME through the interaction with CD206 macrophage receptors (leading to an M2-like polarization) and by promoting the transition of mesothelial cells into specific cancer-associated fibroblasts (CAFs). This review synthesizes current evidence on MSLN transcriptional regulation and its functional implications in invasion, metastasis, and immune evasion. We also summarize ongoing therapeutic strategies targeting MSLN and discuss how TME-driven resistance mechanisms are shaping the next generation of MSLN-directed therapies. By integrating molecular insights with translational perspectives, this work provides a comprehensive overview of MSLN biology and its emerging therapeutic relevance in cancer.

一项基于循证医学系统评价的研究,探讨高分子量和低分子量透明质酸对与骨再生相关的细胞反应中白细胞介素-1、白细胞介素-6、白细胞介素-10、CD44、p53和透明质酸介导的运动受体的影响。

Int J Biol MacromolPMID:41344468

透明质酸(HA)是细胞外基质的关键组成部分,可调节骨再生过程,其生物学性能受分子量特征的强烈影响。透明质酸的低分子量(LMW)和高分子量(HMW)变体在免疫调节和组织再生中发挥着不同作用,尽管它们的确切生物学功能仍是一个持续争论的话题。本系统综述总结了关于LMW-HA和HMW-HA如何影响与炎症、增殖和细胞周期调节相关的关键生物标志物IL-1、IL-6、IL-10、CD44、p53和RHAMM的现有证据。按照PRISMA指南,在三个主要数据库——科学网、PubMed和Scopus中进行了全面的文献检索,以查找2018年至2024年期间发表的文献。总共纳入了11项符合条件的研究,涵盖评估具有明确分子量的HA的体外、体内和离体模型。结果表明,LMW-HA上调IL-1、IL-6、RHAMM和p53,支持早期炎症和细胞增殖,而HMW-HA上调IL-10和CD44,有助于炎症消退和组织修复。混合HA制剂显示出平衡的免疫调节作用,平衡早期促炎和晚期抗炎反应。这些发现突出了HA的分子量依赖性再生作用,LMW-HA促进早期愈合,HMW-HA支持后期组织重塑,为设计基于HA的靶向治疗提供了指导。

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用于生物制造的高度可调谐且可细胞重塑的硫醇-烯藻酸盐-肽交联水凝胶,以重建细胞和类器官微环境。

Adv Healthc MaterPMID:41334632

在本研究中,我们提出了一种用于类器官培养且适用于生物制造技术的细胞介导可降解藻酸盐水凝胶系统。降冰片烯功能化的藻酸盐与可被基质金属蛋白酶裂解的二硫醇化肽序列交联,并在紫外线照射下用半胱氨酸末端的细胞粘附肽RGD进行修饰。水凝胶的硬度可通过调节聚合物和交联剂浓度来控制。预凝胶溶液通过基于气动挤压的系统成功进行了生物打印。这些水凝胶用于封装多种敏感细胞类型。人子宫内膜类器官具有高细胞活力,随时间推移尺寸增大,呈现球形形态,并表达细胞间接触蛋白E-钙粘蛋白和增殖标志物Ki67。封装的小鼠胚胎干细胞来源的甲状腺滤泡产生甲状腺球蛋白和T4。小鼠肠道类器官呈现增殖表型。使用内皮细胞和支持细胞(单细胞悬液和球体)实现了水凝胶内部的血管化。封装的诱导多能干细胞来源的神经球发出的神经突,无论是细束还是粗束,都证明了水凝胶的再支配潜力。这种多糖水凝胶平台可作为从小鼠肉瘤中提取的基底膜基质的一种明确、可调且符合伦理的替代物。

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Electrodermal reactivity in an aversive countdown task: Concurrent and prospective relations with triarchic psychopathy traits and antisocial behavior outcomes in a child-aged sample.

Front PsychiatryPMID:41416047

INTRODUCTION: Considerable evidence exists for reduced electrodermal reactivity to aversive cues/events in high-psychopathic individuals, but most research of this kind has employed adult samples and cross-sectional designs. The current study examined skin conductance (SC) activation during anticipation of and in response to a noise stressor in a sample of 9-10 year old children in relation to constituent traits of psychopathy described by the triarchic model (i.e., boldness, disinhibition, meanness), both concurrently and at a five-year follow-up, and in relation to antisocial behavior at the follow-up. METHODS: Participants were 1,082 children from the greater Los Angeles area who underwent successive waves of testing in a longitudinal twin project. Current study analyses focused on (a) SC from the noise stressor task and parental ratings of children's triarchic traits collected at wave 1 of the project (W1; ages 9-10), and (b) parent- and child-ratings of the triarchic traits along with child-reported engagement in aggressive and nonaggressive antisocial behavior (ASB) collected at wave 3 (W3; ages 14-15). RESULTS: Reduced SC reactivity in the noise-stressor task at W1 was related to parent-rated boldness both concurrently (at W1) and prospectively (at W3), but not to parent-rated disinhibition or meanness at either wave. Interestingly, reduced SC reactivity at W1 showed associations with both boldness and meanness as rated by child participants themselves at W3. Additionally, reduced W1 SC reactivity was uniquely predictive of child-reported nonaggressive ASB at W3, whereas W1 parent-rated boldness was uniquely predictive of child-reported aggressive behavior at W3. DISCUSSION: Our finding of an inverse relationship between SC reactivity and parent-rated boldness at W1 corroborates evidence from prior adult research and points to low fear (threat sensitivity) as the basis of deficient stress responding in psychopathy. The finding of contrasting predictive relations for W1 SC reactivity and W1 parent-rated boldness with ASB at W3 suggests differing roles for elements of threat sensitivity tapped by each (e.g., low anxiousness versus social dominance) in nonaggressive versus aggressive forms of ASB. Our findings highlight the nuances of dispositional fearlessness as construct of relevance to psychopathy and suggest important avenues for future research.

9-PH对TRPM4通道的抑制作用可减轻睡眠剥夺诱导的海马内皮损伤以及随后的神经炎症和神经功能障碍。

Exp NeurolPMID:41349672

睡眠剥夺(SD)是一个重大的公共卫生问题,也是认知障碍的一个公认风险因素。虽然血管功能障碍和神经炎症都与之有关,但其之间的机制联系仍不清楚。在这里,我们确定了一个以内皮瞬时受体电位褪黑素4(TRPM4)为中心的致病性正反馈回路,作为SD诱导病理的核心驱动因素。我们证明,SD会触发海马内皮细胞中TRPM4的早期特异性上调,进而导致血脑屏障(BBB)破坏,其特征为紧密连接丧失和血管周围水肿。这种内皮损伤促进了高迁移率族蛋白B1(HMGB1)的释放,后者激活小胶质细胞的TLR4-NF-κB信号传导和神经炎症。至关重要的是,我们提供了直接证据,表明小胶质细胞衍生的炎症介质以NF-κB依赖的方式反馈上调内皮TRPM4表达,从而建立了一个自我维持的TRPM4-HMGB1-NF-κB回路。在SD发作后用9-菲酚(9-PH)对TRPM4进行药理抑制有效地破坏了这个循环,维持了BBB完整性,抑制了小胶质细胞激活和神经元凋亡,并挽救了海马依赖性认知功能。这些保护作用与HMGB1-TLR4-NF-κB轴的同时下调有关。我们的研究结果确定内皮TRPM4是SD诱导的神经血管单元损伤的主要启动者和放大器,揭示了TRPM4-HMGB1-NF-κB回路是减轻睡眠剥夺认知后果的一个有前景的治疗靶点。

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过度剧烈运动通过一种肌肉来源的线粒体伪装物损害认知功能。

Cell MetabPMID:41344322

过度运动损害认知功能,但其潜在机制尚不清楚。在此,我们表明,过度剧烈运动诱导的乳酸积累刺激肌肉分泌线粒体衍生囊泡(MDV),导致认知障碍。这些MDV(命名为otMDV)的特征是线粒体DNA水平高和表面标志物血小板活化因子(PAF)。它们倾向于迁移到海马神经元中,替代内源性线粒体并引发突触能量危机。从机制上讲,otMDV释放线粒体DNA,激活依赖于环鸟苷酸合成酶-干扰素基因刺激蛋白(cGAS-STING)的驱动蛋白家族成员5的抑制作用,阻止海马线粒体运输到突触。同时,otMDV标志物PAF与突触抑制蛋白协同作用占据线粒体锚定位点,损害突触能量供应。用PAF中和抗体阻断otMDV向海马的迁移可减轻过度剧烈运动诱导的突触丢失和认知功能障碍。值得注意的是,人体研究将循环中otMDV水平升高与认知障碍联系起来。总之,我们的研究结果表明,一种独特的肌肉来源的MDV亚群,它取代海马线粒体并破坏其功能,导致认知能力下降。

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揭示酵母相互作用:深入了解酿酒酵母代谢物在葡萄酒发酵过程中调节戴尔布有孢圆酵母香气生物合成中的作用。

Int J Food MicrobiolPMID:40913991

酿酒酵母与非酿酒酵母通过分泌代谢产物进行的相互作用在塑造葡萄酒香气特征方面起着关键作用,但其潜在机制仍未得到充分理解。本研究采用细胞/培养基分离策略,结合转录组学和代谢组学分析,以阐明酿酒酵母代谢产物对葡萄酒发酵过程中德尔布有孢圆酵母香气生物合成的影响。结果表明,酿酒酵母代谢产物抑制了德尔布有孢圆酵母的生长,并抑制了几种关键挥发性化合物的产生,包括乙酸乙酯、丁酸乙酯和2-苯乙醇。转录组分析显示,德尔布有孢圆酵母中参与香气合成途径的关键基因显著下调,特别是EHT1/EEB1、ARO10、ADH3、HOM2、FAS1和FAS2。非靶向代谢组学分析鉴定出867种代谢产物,其中来自酿酒酵母的5种差异产生的代谢产物显著影响了德尔布有孢圆酵母的香气形成。值得注意的是,腺苷(ADO)、甘油磷酸胆碱(GPC)和2-羟基异己酸(HIA)提高了癸酸乙酯(237.63%)和2-苯乙醇(29.06%)的产量,而N-辛酰甘氨酸(NOG)增加了辛酸乙酯(229.29%)和辛酸(219.36%)的产量。重要的是,吲哚-3-甲醛(ICA)对德尔布有孢圆酵母的生长具有显著抑制作用,并降低了大多数香气化合物的浓度。这些发现为葡萄酒发酵过程中酵母之间的代谢相互作用提供了新的见解,并为酿酒师提供了有针对性地调节葡萄酒香气特征的策略方法。

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一种模拟植物性肉类替代品的模型食品,用于测定基质对单核细胞增生李斯特菌生长的影响。

Int J Food MicrobiolPMID:40934802

单核细胞增生李斯特菌是植物性肉类替代品(PBMA)中备受关注的一种病原体。在各种条件下测试单核细胞增生李斯特菌在实际产品中的生长行为,需要筛选大量的条件和时间点,这既耗时又昂贵。现已开发出一种具有代表性的PBMA模型,可用于测试在不同生长抑制参数存在的情况下单核细胞增生李斯特菌的生长情况。为了尽量减少操作和一次性使用,采用小型化最大可能数(mMPN)方法对单核细胞增生李斯特菌进行计数,该方法与菌落形成单位(CFU)计数具有良好的相关性。该PBMA模型还针对一系列温度(7-15°C)、水活度(低至0.940,通过NaCl调节)以及乳酸和乙酸浓度(分别高达2.5 mM和6 mM未解离酸)进行了验证。对单核细胞增生李斯特菌菌株FBR017的生长进行了定量,并确定了动力学生长参数。除大豆外,还测试了其他植物蛋白来源,包括豌豆、小麦以及小麦/大豆组合。所有基质都能轻易支持单核细胞增生李斯特菌FBR017的生长,根据拟合数据确定的所有蛋白质类型的生长速率相似,这表明植物蛋白类型对PBMA中单核细胞增生李斯特菌的生长速率没有显著影响。所提出的PBMA模型能够改变未解离有机酸(乳酸和乙酸)的浓度以及其他参数(pH值、水活度、NaCl)。这使得在PBMA基质中以所需水平确定各个生长抑制参数的影响成为可能,而这在工业生产的产品中进行测试是不切实际的。

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使用水分散性姜黄素作为光敏剂进行光动力灭活,以灭活家禽胴体上的沙门氏菌和不锈钢食品接触表面上的单核细胞增生李斯特菌。

Int J Food MicrobiolPMID:40913990

在肉类和禽类屠宰加工过程以及食品加工环境中,使用化学抗菌剂之外的其他方法来处理 carcasses,这受到了全球消费者的关注。研究了细菌细胞浓度、膜通透剂以及光敏剂姜黄素(PSC)对大分子的影响,这些因素对沙门氏菌在培养基模型、鸡皮上的灭活作用以及对不锈钢上单核细胞增生李斯特菌生物膜的灭活作用。在液体培养基系统中,添加30mg/mL氯化钙或更高浓度时,与单独使用PSC处理相比,沙门氏菌水平显著降低。氯化钙与PSC联合使用对鸡皮上沙门氏菌的灭活没有增强作用。沙门氏菌细胞密度对单独使用PSC处理没有影响,但当沙门氏菌数量为5至7 log CFU/mL时,与大于7 log CFU/mL相比,PSC与氯化钙联合使用更有效。添加氯化钙导致的光灭活活性增加是由于膜通透性增加以及PSC的细胞摄取增加。PSC介导的光灭活导致细菌DNA破坏。不锈钢上的生物膜暴露于PSC后,单核细胞增生李斯特菌减少了>3.0 log CFU/cm。本研究强调了在体外、食品和食品接触表面评估光动力灭活系统的重要性,以及水分散性姜黄素在控制产品和食品加工环境中食源性病原体方面的潜在用途。 (注:carcasses 原词有误,可能是carcasses,意为屠体、畜体等,这里按推测翻译)

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奥地利牛肉及牛肉生产链中的耐冷梭菌属——存在情况及菌种鉴定

Int J Food MicrobiolPMID:40907291

围绕耐冷梭菌导致真空包装牛肉变质的讨论已经持续多年。然而,牛肉生产链方面的调查却很缺乏。本研究旨在确定这些细菌在屠宰场和切割厂中的污染位点以及它们在牛肉中的存在情况。为此,对来自一家 cattle 屠宰场和一家牛肉切割厂的815份拭子和85份牛肉样本,以及来自维也纳(奥地利)零售市场的71份真空包装牛肉样本进行了分析。应用了三种定量聚合酶链反应(qPCR)系统、16S核糖体RNA(rRNA)测序和培养方法。梭菌在牛皮以及击晕和去皮部位的存在率很高。总体而言,来自切割厂和零售市场的牛肉分别有35.3%和31.0%检测呈阳性。在牛肉样本中检测到的主要菌种为嗜冷肉梭菌、嗜冷栖热梭菌、嗜温梭菌和类塔氏梭菌。这些菌种也在牛皮或屠宰场表面被发现。在将牛肉样本在保质期过后于4℃储存长达1至2周后,分别有73.1%和34.6%的阳性牛肉样本出现异味和大量产气。而在阴性样本中,这些变质迹象仅分别出现在38.5%和20.2%的样本中。这证实了耐冷梭菌污染会导致真空包装肉类的货架期缩短。为减少胴体被这些细菌污染,应制定用于去皮的卫生规程,以及使用经食品行业批准的杀孢子消毒剂对设备和加工表面进行有效表面消毒,并制定相应的监测计划。

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西安市市售预包装食品中小肠结肠炎耶尔森菌的污染状况及ε-聚赖氨酸对其抑菌活性和作用机制研究

Int J Food MicrobiolPMID:40925223

本研究全面评估了ε-聚赖氨酸(ε-PL)对预制肉制品中肠炎耶尔森菌(小肠结肠炎耶尔森菌)污染的抗菌效果及作用机制。来自中国西安(2024年5月至2025年4月)零售猪肉和牛肉样本的监测数据显示,小肠结肠炎耶尔森菌的流行率为50.0%(48/96)。就对小肠结肠炎耶尔森菌的抗菌活性而言,ε-PL表现出显著的抑制作用,最低抑菌浓度(MIC)为200μg/mL,最低杀菌浓度(MBC)为400μg/mL。机制研究表明,ε-PL通过多种途径发挥抗菌作用:(1)破坏细菌细胞膜完整性,导致细胞内蛋白质、核酸和ATP泄漏;(2)诱导活性氧积累;(3)显著抑制细菌运动性;(4)干扰生物膜形成(抑制率为42.29±0.81%)并去除预先形成的生物膜(去除率为56.31±8.19%)。动物实验进一步证明,ε-PL处理有效降低了感染小鼠中小肠结肠炎耶尔森菌的肠道载量和死亡率(从100%降至37.5%),显著减轻了肝脏、脾脏和肠道的病理损伤,并通过降低小肠结肠炎耶尔森菌对紧密连接蛋白(ZO-1和闭合蛋白)表达的抑制作用改善了肠道屏障功能。在实际应用中,ε-PL处理降低了预制猪肉和牛肉中小肠结肠炎耶尔森菌的活菌数(降低2.55 - 3.62 log CFU/g)。这些结果表明,ε-PL作为一种多靶点抗菌剂,在预制肉制品的安全控制和保鲜方面具有巨大潜力。

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揭示中国东部同域中华蜜蜂和意大利蜜蜂所产女贞蜂蜜中可培养和不可培养酵母的生物多样性。

Int J Food MicrobiolPMID:40907289

蜂蜜独特的理化性质为大多数微生物创造了一个受限的环境,但却支持了具有重要生态作用和生物技术潜力的特殊耐渗透压酵母。在本研究中,我们采用了一种依赖培养和不依赖培养相结合的方法,系统地描述了来自中国东部青岛中华蜜蜂和西方蜜蜂蜂群的同域单花贞洁(蔓荆子)蜂蜜中的酵母群落。结果一致表明,在两种方法中,西方蜜蜂蜂蜜中的酵母多样性均显著高于中华蜜蜂蜂蜜。不依赖培养的分析方法确定了接合酵母属是两种蜂蜜类型中的主要属,而西方蜜蜂蜂蜜中未分类真菌类群的比例明显更高。通过培养,从蜂蜜样本中分离出了13种不同的酵母物种和1种丝状真菌,其中几种物种仅与中华蜜蜂或西方蜜蜂蜂蜜相关。重要的是,尽管地理和花蜜来源相同,但两种方法都证实了明显的蜜蜂物种特异性酵母群落结构,突出表明宿主身份驱动微生物分化。生理分析进一步表明,所有分离出的酵母都表现出对高渗透压胁迫和酸性pH的特殊耐受性——这是适应蜂蜜极端环境的关键特征。这些适应性特征,再加上多样的代谢能力,突出了这些与蜂蜜相关的酵母巨大的生物技术潜力,在发酵、生物活性代谢物合成和益生菌方面具有广阔的应用前景。这项研究增进了我们对蜂蜜生态系统中宿主特异性微生物关联的理解,并将蜂蜜定位为一个功能多样的酵母的宝贵宝库,用于生物技术探索。

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低糖果味饮料变质过程中布鲁氏酒香酵母对山梨酸的抗性及代谢

Int J Food MicrobiolPMID:40945056

布鲁塞尔酒香酵母是低糖乙醇发酵过程和酒精饮料中一种新出现的腐败酵母。随着软(非酒精)饮料制造商向低糖配方转型,本研究调查了布鲁塞尔酒香酵母在不同软饮料和防腐剂条件下的生长能力。在多种软饮料配方中,包括无糖柠檬水、低糖果汁和碳酸饮料,多种布鲁塞尔酒香酵母分离株的生长情况与常见的腐败酵母拜耳接合酵母相当。在补充了低浓度(0.1%)葡萄糖的实验室基本培养基中对布鲁塞尔酒香酵母进行的生长试验,其特征在于浑浊的生物量积累(一种腐败指标)以及对主要食品防腐剂山梨酸(SA)的抗性,已知山梨酸会引起氧化应激并抑制呼吸作用。对呼吸发酵代谢的分析表明,无论葡萄糖浓度如何,布鲁塞尔酒香酵母都更倾向于呼吸作用而非发酵作用,氧气限制会显著降低其生长。细胞间异质性被用作一种工具,以测试呼吸性活性氧(ROS)的细胞水平是否会影响该生物体的SA抗性表型。在低葡萄糖条件下,具有高背景ROS的分选细胞亚群比低ROS细胞对SA更具抗性。此外,抗氧化剂N-乙酰半胱氨酸(NAC)使这些细胞亚群对SA高度敏感。因此,尽管该生物体主要进行呼吸代谢但仍具有SA抗性的一种解释可能是,呼吸性ROS增强了细胞对(随后的)SA诱导的氧化应激的恢复能力。这项工作表明,布鲁塞尔酒香酵母能够在无糖或低糖培养基和饮料配方中生长,并且能够在相对较高的山梨酸水平下生长。

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利用乳酸菌生物保护培养物控制即食三文鱼产品中的单核细胞增生李斯特菌:是什么阻碍了从研究到工业应用的转变?

Int J Food MicrobiolPMID:40885074

单核细胞增生李斯特菌对即食(RTE)三文鱼产品,包括新鲜和轻度加工产品,如冷熏三文鱼(CSS)或腌渍生三文鱼,构成了持续的食品安全挑战,这促使人们需要新的保鲜策略。一个有前景的解决方案是生物保鲜,即应用乳酸菌(LAB)的保护性培养物或其代谢产物作为天然的抗李斯特菌剂。肉食杆菌属、明串珠菌属和Latilactobacillus是三文鱼产品中天然存在的多种乳酸菌之一。它们已被应用于食品发酵过程数十年,并执行多种抗菌机制。它们对三文鱼原料和所应用加工因素的适应性,使其成为此类产品生物保鲜的有趣候选者。然而,由于它们的抗李斯特菌效率以及对产品感官质量参数的影响取决于产品,因此需要仔细选择菌株。在本综述中,我们重点介绍了利用具有生物保护作用的LAB培养物对即食三文鱼产品进行生物保鲜的最新知识,重点关注从研究到工业应用的转变。讨论了即食三文鱼产品生物保鲜的标准,包括菌株选择、应用方法和工艺调整。最后,我们讨论了扩大到工业应用面临着几个必须克服的挑战,如消费者接受度、法规、商业发酵剂的可用性,以及在海产品生产环境中处理和应用LAB的稳健策略。

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1990 - 2023年204个国家和地区心血管疾病及风险因素的全球、区域和国家负担

J Am Coll CardiolPMID:40990886

背景:心血管疾病(CVDs)是全球主要的死亡原因,也是导致残疾的首要原因之一。自1990年以来,大多数国家的心血管疾病负担持续增加,这种趋势受到有害风险因素暴露变化、人口增长和人口老龄化的驱动。 目的:我们报告全球、国家和次国家层面心血管疾病负担的估计数据,包括18种亚疾病和12种相关的可改变风险因素。我们分析了1990年至2023年心血管疾病负担的变化,并确定了变化的驱动因素,包括人口增长、人口老龄化和风险因素暴露。 方法:全球疾病负担(GBD)2023研究是一项跨国合作研究,对包括心血管疾病负担在内的375种疾病的负担进行了量化,并利用所有可用数据和统计模型确定了1990年至2023年的变化驱动因素。GBD 2023估计了1990年至2023年204个国家和地区的人群层面疾病负担。 结果:心血管疾病是GBD中估计的伤残调整生命年(DALYs)和死亡的主要原因。截至2023年,全球有4.37亿(95%不确定区间:4.01亿至4.65亿)心血管疾病伤残调整生命年,比1990年的3.2亿(2.92亿至3.44亿)增加了1.4倍。缺血性心脏病、脑出血、缺血性中风和高血压性心脏病是2023年全球心血管疾病导致伤残调整生命年的主要原因。截至2023年,年龄标准化的心血管疾病伤残调整生命年率在社会人口指数(SDI)较低和中低水平地区最高,在高SDI地区最低。全球心血管疾病死亡人数从

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通过超薄切片术制备用于析氢的全边缘二硫化钼

ACS NanoPMID:41144765

硫化钼是一种很有前景的析氢反应(HER)催化剂,已知其边缘位点的活性明显高于基面。然而,诸如边缘堆积和电子穿过基面必须经过的距离等外部因素的影响仍未得到充分研究,主要原因是缺乏精确的硫化钼结构化方法。现有方法通常会产生同时包含基面和边缘位点的混合物,限制了对活性位点暴露的控制。在这里,我们开发了一种基于切片的方法,使用超薄切片技术制造仅由边缘终止组成的硫化钼结构,其间距和与底层电极的距离可调。该技术能够对边缘形态、排列和电化学可及性进行强有力的控制。在玻碳上对这些精确切片的全边缘硫化钼结构的HER性能进行基准测试,结果显示出一种趋势,即更薄、更无序和开放边缘的排列优于更厚、紧凑和对齐的切片。这表明催化性能不仅取决于边缘丰度,还取决于可及性、几何开放性和基面中的电子转移电阻。原始的垂直取向硫化钼在10 mA cm时的过电位约为300 mV,高于一些化学修饰的硫化钼体系;然而,通过金纳米颗粒修饰,过电位降至180 mV,与最先进的基于硫化钼的催化剂相当。我们的研究结果提供了对硫化钼中HER活性的机理理解,为二维(2D)电催化剂的合理边缘工程提供了一个平台,并显示了通过自动化切片和转移过程实现未来规模化的潜力。

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胰高血糖素样肽-1受体激动作用改变前列腺癌的生长和治疗反应。

Endocr Relat CancerPMID:41257454

胰高血糖素样肽-1受体(GLP1R)激动剂迅速显现的代谢益处已使其广泛用于治疗2型糖尿病和肥胖症。虽然药理学上的GLP1R激动剂司美格鲁肽主要激活胰腺中的GLP1R信号传导,但GLP1R在晚期前列腺癌中也有表达,在那里GLP1R激动作用可能直接改变细胞信号传导。由于代谢紊乱及其治疗在前列腺癌患者中很常见,了解司美格鲁肽在前列腺细胞中的作用对于解读其全身效应以及确定对前列腺癌结局的潜在影响至关重要。在前列腺癌模型中,司美格鲁肽降低了细胞增殖、糖酵解功能和磷酸激酶介导的信号传导。GLP1R下游信号传导的这种总体抑制与抑制性GPCR信号传导一致,这通过降低的cAMP水平得到证实。此外,单独使用司美格鲁肽以及与恩杂鲁胺联合使用时细胞增殖均减少,这支持GLP1R激动作用作为单一疗法或增强雄激素受体信号抑制剂的治疗益处可能具有治疗作用。有趣的是,在一个转分化模型(n = 55)中,GLP1R和AR表达呈负相关,而GLP1R与神经内分泌前列腺癌标志物(DLL3、ASCL1)呈正相关,这表明GLP1R与神经内分泌分化之间存在关联。对公开可用的患者RNA测序数据(n = 664)进行的生物信息学分析发现,晚期前列腺癌中GLP1R表达明显高于良性前列腺,在晚期前列腺癌中它与Notch信号传导阴性相关。综上所述,我们的数据支持一种模型,其中GLP1R激动作用阻断前列腺癌细胞的致癌信号通路和生长,这可能被用于晚期前列腺癌男性患者的治疗。

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人类序列信号预测的神经生物学:来自语言、音乐和数学的见解。

Neurosci ResPMID:41344536

人类使用各种顺序信号,如语言、音乐和数学,来传达复杂信息并促进交流。先前的研究已经确定了人类顺序信号处理背后的两个基本框架:一个是结构框架,强调基于规则的层次组织(如句法);另一个是预测框架,它关注大脑根据统计规律预测即将到来的输入的能力。虽然结构方法强调人类特有的能力,但预测方法突出了与非人类动物共有的机制。我们回顾了跨领域的行为和神经证据,证明了重叠的神经基质,特别是在额下回,参与了语言、音乐和数学的结构处理。同样,由N400和P600等ERP成分索引的预测处理在各个领域都起作用,以检测期望的违反情况。重要的是,我们认为这些框架并非相互排斥:结构知识可以为预测提供信息,而预测过程反过来又可以影响感知到的结构。跨领域实验和计算建模表明存在共享的认知机制,尽管仍存在特定领域的差异。我们提出,人类大脑将层次结构与统计学习相结合,以支持灵活和通用的序列处理。未来的研究应旨在利用神经成像技术和大语言模型开发跨领域的统一模型。

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Delta样配体4介导的髓源性抑制细胞代谢重编程促进肌联蛋白失活的三阴性乳腺癌新辅助治疗耐药性。

Mol BiomedPMID:41326912
Delta样配体4介导的髓源性抑制细胞代谢重编程促进肌联蛋白失活的三阴性乳腺癌新辅助治疗耐药性。

三阴性乳腺癌(TNBC)具有复杂的基因组背景和治疗抗性。我们首先定义了“肌联蛋白(TTN)失活”,即TTN表达缺陷或突变的状态,其影响肿瘤进展。然而,TTN失活如何调节免疫逃逸并影响治疗抗性仍不清楚。我们使用全外显子组测序、单细胞转录组测序和空间转录组测序,筛选了接受新辅助治疗的TTN失活TNBC患者的临床特征。同时,我们使用CRISPR-Cas9技术构建了各种突变TNBC细胞系。携带TTN和Delta样配体4(DLL4)的慢病毒载体在体内得到验证,以验证潜在机制。使用糖酵解相关分子实验测量髓源性抑制细胞(MDSCs)的代谢功能。在原位MCT4基因修饰小鼠模型中探索针对TTN失活TNBC的免疫治疗药物。在TTN失活的TNBC中建立了DLL4调节的生态位。机制上,TTN缺陷和突变导致TNBC中DLL4分泌。DLL4通过MDSCs衍生的NOTCH2信号通路增强MCT4介导的糖酵解,驱动MDSCs的恶性功能和乳酸排泄。DLL4衍生的MDSCs通过诱导TNBC中的组蛋白乳酸修饰促进干性介导的耐药性,抑制CD8T细胞的抗肿瘤活性。阻断DLL4-MCT4轴可刺激抗肿瘤免疫,并与抗PD-1协同作用,提高TNBC一线新辅助治疗的反应率。我们的研究揭示了TTN调节肿瘤免疫微环境的内在机制,并为TTN失活的TNBC免疫治疗提供了潜在靶点。

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沸石催化剂中焦炭诱导的失活:机理、抗结焦改性及再生方法。

Dalton TransPMID:41170840

沸石催化剂广泛应用于石油化工和炼油过程中,不可避免地会逐渐失活。在各种失活途径中,焦炭诱导的失活最为关键,这是由于含碳物质在酸性位点上逐渐沉积以及随后微孔被堵塞所致。焦炭形成的特征、机理和动力学受到沸石结构、酸性性质和操作条件的强烈影响,这凸显了从分子层面理解以指导催化剂设计和再生的必要性。本综述通过涵盖焦炭形成的机理和物理化学特征、通过合理的催化剂设计提高抗焦性的策略以及最新的再生方法,总结了沸石催化剂焦炭诱导失活的最新进展。通过将基本见解与实际策略相结合,这项工作旨在支持耐用沸石催化剂的开发以及可持续工业应用的高效再生方案。

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一种利用高光谱航空图像改进考拉栖息地预测的新方法。

Sci Total EnvironPMID:41338074

考拉种群数量正在下降,主要原因是栖息地丧失,因此大规模的栖息地质量预测对于保护工作至关重要。定义考拉栖息地质量的第一种方法是确定现存不同“考拉”树种的数量及其各自的化学成分。以往的研究使用了从无人机到卫星的遥感技术来测量这些因素。虽然尺度和分辨率之间的权衡在不断发展,但机载高光谱数据目前为开发预测模型提供了一条有前景的途径。过去,利用机载数据预测氮含量的考拉研究取得了相对较高的准确率,但它们没有探索对考拉树种进行分类的潜力,也没有将这个解释变量纳入氮模型。在这里,我们在测试一种新方法的同时检验这些想法:使用单个树冠像素而非树冠平均值来训练模型。我们认为像素级训练会使模型接触到有噪声的像素(不同的阴影、角度或背景),迫使它们仍然能够找到模式,并提高对新数据的鲁棒性。此外,这种方法通过利用树冠内的变异性增加了训练数据,减少了对大量采样工作的需求。我们发现,使用单个像素进行物种分类的准确率达到了96%,但经过多次迭代后收敛到了与使用树冠平均反射率相同的准确率(74%)。此外,我们证明像素级训练和明确纳入树种显著改进了氮预测模型(R = 0.61)。我们的研究结果支持在未来的机载数据中使用这种方法,从而改进预测考拉栖息地的模型。这样的模型为区域尺度的栖息地评估和保护决策提供信息,有助于确定高价值区域的优先次序。

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Cntn4基因缺陷促进与小鼠肠道微生物群紊乱和肠-脑轴代谢组学改变相关的自闭症样表型。

Mol NeurobiolPMID:41326871

自闭症谱系障碍(ASD)涉及复杂的基因-环境相互作用,其中肠道微生物群(GM)-脑轴起着关键作用。为了探究ASD风险基因Cntn4是否通过肠-脑连接促进疾病发展,我们的研究采用了Cntn4基因敲除小鼠模型。使用16S rDNA测序评估这些小鼠肠道内容物中的微生物多样性和丰度,同时通过代谢组学方法检测肠道内容物、血清和大脑皮层中的代谢物变化。结果表明,Cntn4基因敲低诱导小鼠出现自闭症样行为变化并加速肠道运输。与对照组相比,在GM组成和代谢组学图谱中观察到显著差异。值得注意的是,鉴定出GM的改变(例如, Adlercreutzia、脱硫弧菌科未分类)以及包括精氨酸-脯氨酸、组氨酸、鞘氨醇、酪氨酸和嘌呤代谢在内的几种代谢途径的破坏。多组学分析将微生物变化与肠道内容物、血清和大脑皮层中的代谢物变化联系起来,尤其是有机酸。这些发现表明,Cntn4基因敲除可能通过与GM和肠-脑轴代谢物改变相关的机制导致小鼠出现自闭症样变化。本研究为ASD发展的潜在机制提供了有价值的见解,并为ASD的预防和治疗提供了潜在方向。

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富含安第斯谷物和巴塔哥尼亚刺李的谷物棒的开发():营养成分、酚类含量、抗氧化剂、质地和感官评价。

FoodsPMID:41376064

谷物棒是添加具有功能价值成分的便捷载体。在此背景下,本研究旨在制作富含藜麦、苋菜籽和卡拉法特()的谷物棒,并评估其仪器质地、总酚类化合物、抗氧化能力、营养成分和感官评价。:开发了四种配方,一种成分均衡的基线谷物棒(F1)、一种富含假谷物的谷物棒(F2)、一种高卡拉法特含量的谷物棒(F3)和一种仅含燕麦的对照棒(F4)。使用单轴压缩测量质地,通过福林-西奥尔特法测定总酚类化合物(TPC),并通过DPPH法评估抗氧化能力。使用食物成分表和膳食参考摄入量(DRIs)从理论上估计营养成分。使用情感测试进行感官评价,包括可接受性、偏好、购买意愿和感官属性。:各配方在仪器硬度方面存在显著差异。F3的总酚含量最高,抗氧化能力也最高。估计的营养成分表明,这些谷物棒提供了充足的能量和相关的微量营养素(钙、镁、铁、锌),以及来自卡拉法特的生物活性化合物。感官评价表明,F2获得了最高的总体接受度和最高的可接受性指数。各配方之间的购买意愿没有差异。在属性评价中,结果表明中等硬度能使接受度最大化,而较软(F1)或较硬(F3-F4)的谷物棒则不太受欢迎。:在F3中添加卡拉法特可增强其酚类和抗氧化特性,而与更多使用膨化假谷物相关的中等硬度有利于F2被消费者接受。观察到的差异证实,配方设计能够调节谷物棒的功能、机械和感官特性。

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